У значному об’ємі міжрайонні і внутрірайонні перевезення вантажів Далекосхідного району здійснюються морським транспортом. Плавання в суворих арктичних морях забезпечується за допомогою криголамів. До Північної морської дороги примикає річка Олена, твірна транспортну пере­мычку між залізничною магістраллю і морським дорогою уздовж берегів Північного Льодовитого океану. Абсолютно інший режим роботи морського транспорту Тихоокеанського Морея. Прак­тічеськи круглий рік здійснюються внутрірайонні і междуна­родные перевезення по Японському і Берінга морям. Головними вантажами в перевезеннях по Далекосхідному району є ліс, вугілля, будівельні матеріали, нафта, риба і продовольчі товари. Найбільші порти цього
Морея Тікси, Ваніно, Петро­павловськ-камчатський, Нагаєво (Магадан), Владивосток, Знахідка, Радянська Гавань.
Автомобільними дорогами район забезпечений слабо. Але в районах, відірваних від інших транспортних доріг, значення автотранспорту велике. Для далеких перевезень є декілька крупних автомагістралей, наприклад, з півдня в Республіку Саха веде дорога Невіри — Алдан — Якутськ. Найпівнічніша дорога проходит від Якутська ка Магадана. Велике транспортне зна­чение має дорога Хабаровськ — Біробіджан, Колимський тракт. Окрім автомагістралей на півночі району є безліч зимових автодоріг і доріг місцевого значення. Розвиненіша мережа автомобільних доріг в південних районах Далекого Сходу.
Величезно для Далекого Сходу значення повітряного транс­порта як для зв’язків з іншими районами Росії, так і для внутрірайонних перевезень (особливо для пасажироперевезень). Літаками і вертольотами здійснюються зв’язки з труд­нодоступными районами. На величезних просторах півночі Далекого Сходу разом з іншими видами транспорту сохра­няется оленячий транспорт.
Програмні заходи щодо розвитку транспортної інфраструктури, передбачені Федеральною цільовою програмою економічного і соціального розвитку Далекого Сходу і Забайкалья на 1996-2005 рр., включають закінчення будівництва Бама і АЯМа (Амуро-якутской магістралі), реконструкцію ділянок Транссиба і створення єдиної желез­нодорожной мережі Сахаліну, будівництво двох мостових переходів через Амур, розширення перевантажувальних потужностей 12 морських портів, формиро­вание опорної автодорожньої мережі (у тому числі завершення автодороги Чи­та - Хабаровськ), реконструкцію аеропортів і оновлення авіапарку. Має бути покращуване транспортне обслуговування північних територій. Базовий порт Ленського басейну після завершення АЯМа буде перенесений до Якутська.