Вказані чинники знижують до певної міри народногосподарську цінність портів області Калінінграда.
Морський торгівельний порт (КМТР) Калінінграда – найзахідніший незамерзаючий порт Російської Федерації на Балтійському морі. Він розташований в гирлі річки Преголі при її впаданні в затоку Калінінграда. Проектна потужність перевантажувальних комплексів – 8,2 млн. тонн вантажів в рік. Основним видом діяльності торгівельного порту є навантажувально-розвантажувальні роботи. Максимальна кількість вантажів, яка перероблялася в морському порту, складала 4,4 млн. тонн (1988 р.), а в 1995 році було перероблено всього 1,85 млн. тонн. У 1996 році об’єми вантажів зросли і склали 2,32 млн. тонн.
Зовнішньоторговельні зв’язки по перевезенню вантажів з порту здійснюються більш ніж з двадцятьма сторінками Західної Європи і Америки. Перевозяться вантажі – вугілля, будматеріал, цукор, кольорові матеріали складають 25-35%. У загальному об’ємі перенавантажуваних вантажів до 50% займає зерно, 10-20% - деревина.
Морський рибний порт утворений в 1947 році на базі колишньої Лісової гавані. Він обслуговував рыбодобывающий флот. Порт спеціалізується на вивантаженні, переробці рыбопродукции, має потужні холодильники, складські приміщення для комплексного постачання рыбопромыслового флоту. Проектна потужність обробки вантажів – 2,5 млн. тонн в рік. Вантажообіг з 1992 р. по 1996 р. виріс з 0,93 до 1,5 млн. тонн за рахунок залучення до переробки раніше невластивих вантажів: нафтопродуктів, добрив і продовольчих товарів.
Річковий порт Калінінграда входить в західне річкове пароплавство і спеціалізується на перевалці насипних вантажів (будівельні матеріали, вугілля, добрива, зерно). Проектна потужність – 3 млн. тонн вантажів в рік. Пароплавство перевозить вантажі в 100 портів Прибалтійських держав і країн Північного моря, використовуючи судна типа “річка - море”.
Окрім морського і річкового портів, важливу роль в розвитку комплексу грає залізничний транспорт. До складу залізниці Калінінграда входять 55 станцій. Залізничний транспорт займає провідне місце в об’ємі всіх видів транспортних послуг, обслуговуванні потреб господарського комплексу області, зовнішньоекономічних зв’язках області.
Загальна протяжність залізниць складає 756 км., у тому числі 100 км. відносяться до внутрішніх, забезпечуючих зв’язок між підприємствами і основними залізничними лініями. По мірі насиченості залізничною мережею область займає сьоме місце в Росії. Залізниця Калінінграда зв’язує і річкові порти, целюлозно-паперові заводи і багато крупних промислових підприємств області.